Fondo antico (cinquecentine, incunaboli, manoscritti sei-settecenteschi): ca 40

Fondo Giovan Battista Venturi (XVIII-XIX secolo): 350 lettere autografe, frammenti di copialettere e documenti personali e familiari

Fondo Masetti da Bagnano (XIX secolo): 165 documenti contabili e d’amministrazione; 209 documenti amministrativi e vari; 868 lettere; n. 14 tavole di poderi

Raccolta Vinciana Gustavo Uzielli (XIX secolo): comprende circa 300 opere tra le più importanti pubblicazioni leonardiane edite fino al 1910, oltre ad un fascicolo contenente documenti personali e di famiglia

Fondo Renato Fucini: (XIX-XX secolo) 39 documenti vari (manoscritti, lettere e disegni autografi)

Fondo Corsi (XIX secolo): 124 documenti

Fondo Smiraglia-Scognamiglio (XX secolo): 13 tra volumi, documenti e manoscritti

Fondo Favaro (XX secolo): 510 lettere della corrispondenza di Antonio e Giuseppe Favaro, appunti e bozze di studi di Antonio Favaro, 217 tra bozze e appunti su Leonardo e la meccanica del corpo umano di Giuseppe Favaro, 170 lettere di Enrico Carusi ai Favaro

Fondo Giuseppina Fumagalli (XX secolo): 4.028 unità, di cui 2.615 lettere, 148 volumi, 1.265 documenti vari

Fondo Luigi Boldetti: corrispondenza (lettere, biglietti, ecc.) per 30 unità

Fondo Matvei A. Gukowskij: corrispondenza (lettere, biglietti, ecc.) per 43 unità

Fondo Giani: corrispondenza (lettere, biglietti, ecc.) per 275 unità

Fondo «Fondazione della Biblioteca Leonardiana»: corrispondenza (lettere, biglietti, ecc.) per 174 unità